1、文件系统类型的区别：FAT32 文件系统，FAT32使用4个字节（也就是32位）的空间来表示每个扇区（Sector）配置文件的情形，故称之为FAT32，其分区容量下限是 512MB，不同操作系统的上限不同；exFAT 文件系统是Microsoft在Windows Embeded 5.0以上（包括Windows CE 5.0、6.0、Windows Mobile5、6、6.1）中引入的一种适合于闪存的文件系统，解决了FAT系统的存储格式，也没有采用NTFS分区的【日志式】文件系统，比较适合闪存保存截止使用。

2、单个文件容量的区别：大多数优盘在格式化时选用FAT32为默认文件系统，但文件大小上限为4GB；exFAT单文件大小最大理论容量可达16EB，相当于16×1024×1024TB；同一目录下最大文件数可达2,796,202个。